144 Arbeiten
Diese Studie nutzt eine robotergestützte Pipeline und maschinelles Lernen an Hefe, um ein altersaufgelöstes Einzelzell-Atlas des Proteoms zu erstellen, das weitreichende räumliche Umstrukturierungen aufdeckt und zeigt, dass biophysikalische strukturelle Eigenschaften bestimmen, welche Proteine während des Alterns instabil werden.
Diese Studie nutzt eine räumliche Einzelzell-Proteomanalyse an Hefe, um zu zeigen, dass die Alterungshallmarken durch einen Verlust der subzellulären Kompartimentierung und Aggregation von Proteinen zusammenhängen, wobei eine hierarchische Abfolge von zellulären Fehlern beginnt, die durch die Desorganisation der Nukleolen, den Abbau der Proteostase und mitochondriale Dysfunktion eingeleitet wird.
Die Studie zeigt, dass eine hochdosierte Vitamin-D-Supplementierung bei vape-exponierten weiblichen Ratten Entzündungs- und Gerinnungswerte sowie Nikotinspiegel senken und so die durch Vaping verursachten pathologischen Veränderungen in der Lunge mildern kann.
Eine großangelegte Studie an Herztransplantationspatienten zeigt, dass ein höheres Alter des Empfängers mit einer verringerten Wahrscheinlichkeit für Abstoßungsreaktionen sowie altersbedingten Veränderungen in der Zusammensetzung und Genexpression des Immunsystems einhergeht, was eine personalisierte Immunsuppression begründet.
Die Studie stellt CELLSWARM vor, ein Framework, das handkodierte Regeln durch LLM-gesteuerte Zellagenten ersetzt, um die Dynamik des Tumormikromilieus präzise nachzubilden und gleichzeitig Fähigkeiten wie kreuzkrebsspezifische Generalisierung, Vorhersage von Therapieansprechen und das Erfassen indirekter genetischer Störungen zu ermöglichen, die über traditionelle Modelle hinausgehen.
Die Studie zeigt, dass die durch Entzündungssignale vermittelte Aktivierung des Transkriptionsfaktors NF-κB die p53-Akkumulation verstärkt und deren dynamisches Verhalten von oszillierend zu anhaltend verändert, was paradoxerweise die DNA-Reparaturfähigkeit der Zellen beeinträchtigt.
Die Studie stellt den „Web of Microbes Agent" vor, ein autonomes System, das ein Bayesianisches Personalized Ranking-Modell mit einem Phydon-Wachstumsmodell und einem Large Language Model kombiniert, um bakterielle Substratpräferenzen präzise vorherzusagen, gezielte Wachstumsbedingungen zu identifizieren und neue Hypothesen für die Mikrobiomforschung zu generieren.
Die Studie zeigt durch integrierte Omics-Analysen, dass eine fein abgestimmte Umgestaltung des Phosphatidylinositol-Profils für die Differenzierung von Kolonozyten entscheidend ist und dass der Verlust dieses lipidischen Remodelings sowie die gesteigerte Phosphoinositid-Metabolisierung wesentliche Merkmale der kolorektalen Malignisierung darstellen.
Die Studie zeigt, dass die entgegengesetzten Regulationsprogramme der Xylempathogene *Xanthomonas campestris* und *Ralstonia solanacearum* durch die spezifischen Infektionswege und die Strömungsrichtung des Xylemsaftes geformt werden, um einen optimalen Kompromiss zwischen Vermehrung und Ausbreitung zu erreichen.
Die Studie etabliert ein quantitatives Zwei-Phasen-Alternsmodell, das auf einer statistischen Analyse von Fliegen- und Mausdaten basiert und zeigt, dass der Übergang in den „Smurf"-Zustand durch eine exponentiell steigende Übergangsrate sowie eine unmittelbar danach einsetzende, stark erhöhte und schnell abklingende Sterblichkeit gekennzeichnet ist.
Diese Studie nutzt Multi-Omics-Ansätze an menschlichen Nierenbiopsien, um zu zeigen, dass bei der fokalen segmentalen Glomerulosklerose (FSGS) eine komplementvermittelte Aktivierung von Podocyten und parietalen Epithelzellen die Krankheitsprogression und Fibrose antreibt, was neue Ansatzpunkte für stadienspezifische Therapien eröffnet.
Die Autoren stellen eine vielseitige photolithografische Methode vor, die es ermöglicht, mit kommerziell erhältlichen Reagenzien sowohl Glas- als auch PDMS-Oberflächen in versiegelten Mikrofluidikgeräten mit verschiedenen Biomolekülen zu mustern, wodurch präzise in-situ-Oberflächenmodifikationen und die Anwendung in der Detektion oder Genexpression ermöglicht werden.
Diese Studie nutzt par-seqFISH, um die Transkriptionsaktivität einzelner Lambda-Phagen in infizierten E.-coli-Zellen aufzulösen und zeigt, dass die Entscheidung zwischen Lyse und Lysogenie auf einem Konsens der viralen Aktivität beruht, wobei lytische Zellen dennoch einzelne Phagen mit lysogener Aktivität enthalten können.
Die Studie zeigt, dass Mikrogravitation bei C. elegans durch die Unterdrückung mechanosensorischer Gene zu vorzeitiger Alterung und neuromuskulären Defekten führt, die jedoch durch die Wiedereinführung taktiler Reize im Kulturmedium teilweise rückgängig gemacht werden können.
Diese Arbeit stellt einen verbesserten Zellverfolgungsalgorithmus vor, der auf einem offenen Multi-Agenten-System und einem erweiterten Kalman-Filter basiert, um die dynamischen Interaktionen, die Mitose und die Migration heterogener Zellpopulationen (insbesondere Osteosarkom- und mesenchymale Stromazellen) in komplexen Ko-Kultur-Modellen präzise zu modellieren und zu verfolgen.
Die Studie zeigt, dass organspezifische proteomische Alterungsuhr-Modelle über ein Jahrzehnt hinweg stabile, interpretierbare Indikatoren für die biologische Alterung darstellen, deren dynamische Veränderungen subklinische Risikofaktoren widerspiegeln und durch Faktoren wie die Menopause sowie medikamentöse Interventionen beeinflusst werden.
Diese Studie zeigt mittels räumlicher und einzelzelltranskriptomischer Analysen, dass bei Zöliakie Enterocyten durch eine verkürzte Distanz zwischen BMP- und WNT-produzierenden mesenchymalen Zellen und die daraus resultierende Überlappung morphogener Felder eine neue Identität mit überlappenden zonalen Programmen sowie eine metaplastische Umwandlung in gastrale Pitszell-ähnliche Zellen entwickeln.
Die Studie zeigt, dass stochastische Mutations-Selektions-Dynamiken auf degenerierten Fitnesslandschaften trotz fehlender Fitnessgradienten eine gerichtete Drift hin zu flachen, robusten Regionen bewirken, da die Landschaftskrümmung die phänotypische Variation formt und so eine implizite Bias erzeugt.
Diese Studie zeigt durch eine integrative Fünf-Ebenen-Analyse, dass die Differenzierung von Leishmania-Parasiten nicht durch genomische Anpassungen, sondern maßgeblich durch posttranskriptionelle Mechanismen wie mRNA-Umsatz, Übersetzungsanpassungen und eine essentielle proteasomale Proteinabbau-Regulation gesteuert wird.
Die Studie zeigt, dass die Integration realer dreidimensionaler zellulärer Strukturen und räumlicher Reaktionsregeln in Modelle des Hefe-Galactose-Schalters zu qualitativ anderen regulatorischen Vorhersagen führt als herkömmliche, räumlich homogene Ansätze.